Genotyping of Mycobacterium tuberculosis isolates from alow-endemic setting in northwestern state of Paraná in Southern Brazil

The purpose of this study was to provide information about the genetic diversity and prevalent genotype of Mycobacterium tuberculosis in a low-endemic setting in northwestern state of Paraná in Southern Brazil. We employed spoligotyping and mycobacterial interspersed repetitive units-variable number tandem repeat (MIRU-VNTR) techniques to genotype M. tuberculosisisolates from patients with pulmonary tuberculosis (TB). The 93 isolates analyzed by spoligotyping were divided into 36 different patterns, 30 of which were described in the SITVIT database. Latin American and Mediterranean, Haarlem and T families were responsible for 26.9 percent, 17.2 percent and 11.8 percent of TB cases, respectively. From the 84 isolates analyzed by MIRU-VNTR, 58 shared a unique pattern and the remaining 26 belonged to nine clusters. The MIRU loci 40, 23, 10 and 16 were the most discriminatory. A combination of MIRU-VNTR and spoligotyping resulted in 85.7 percent discriminatory power (Hunter-Gaston index = 0.995). Thus, combining spoligotyping and MIRU-VNTR typing proved to be most useful for epidemiological study in this low-endemic setting in Southern Brazil. The current study demonstrated that there is significant diversity in circulating strains in the city of Maringá and the surrounding regions, with no single genotype of M. tuberculosispredominating.

Classic and molecular study of Giardia duodenalis in children from a daycare center in the region of Presidente Prudente, São Paulo, Brazil / Estudo clássico e molecular de Giardia duodenalis em crianças atendidas em uma creche na região de Presidente Prudente, São Paulo, Brasil

Epidemiological studies on giardiasis by using molecular techniques such as RAPD (Randomly Amplified Polymorphic DNA) may give information on factors related to the transmission of Giardia duodenalis. The aim of this work was to assess the epidemiology of G. duodenalis in 101 children attended at a daycare center in Presidente Bernardes, SP, Brazil. After parasitological examinations in feces samples, 15 children presented cysts of G. duodenalis. Their respective parents, brothers and pets, besides the daycare center workers, also had their feces submitted to parasitological analysis. Seven mothers and nine brothers also presented G. duodenalis cysts, while fathers, daycare workers and pets (dogs) did not presented the parasite. Besides the 15 cases with G. duodenalis, other 23 children presented other enteroparasites (Entamoeba coli, Endolimax nana, Enterobius vermicularis, Ascaris lumbricoides and Trichuris trichiura). Samples of G. duodenalis cysts from children and their relatives were submitted to molecular typing by RAPD after genomic DNA extraction and amplification of a fragment of the 18S rDNA region by PCR. After examining 31 isolates of G. duodenalis (children and their respective mothers and brothers), it was concluded that the parasite transmission occurred in children, probably during daily cohabitation at the daycare center, but not at home among their relatives or pets.

Estudos epidemiológicos sobre giardíase por técnicas moleculares como a RAPD (Amplificação aleatória do DNA polimórfico) podem contribuir para o entendimento de fatores relacionados à transmissão de Giardia duodenalis. O objetivo desse trabalho foi estudar a epidemiologia de G. duodenalis em 101 crianças atendidas em uma creche em Presidente Bernardes, SP, Brasil. Após exames parasitológicos em amostras de fezes, 15 crianças apresentaram cistos de G. duodenalis. Seus respectivos pais, irmãos e animais domésticos, além dos funcionários da creche, foram submetidos a exames parasitológicos de fezes. Destes, sete mães e nove irmãos apresentaram G. duodenalis, enquanto os pais, funcionários da creche e animais de estimação (cães) não apresentaram o parasita. Além dos 15 casos com G. duodenalis, outras 23 crianças apresentaram outros enteroparasitas (Entamoeba coli, Endolimax nana, Enterobius vermicularis, Ascaris lumbricoides e Trichuris trichiura). As amostras contendo cistos de G. duodenalis das crianças e de seus parentes foram submetidas à análise molecular por RAPD após extração do DNA genômico e amplificação de um fragmento de uma região do rDNA 18S por PCR. Entre os 31 isolados de G. duodenalis (crianças e suas respectivas mães e irmãos), concluiu-se que a transmissão dos parasitas ocorreu entre as crianças, provavelmente durante seu convívio na creche, mas não foi decorrente do convívio familiar ou animais de estimação.

Ocorrência de tuberculose em um hospital psiquiátrico do interior de Goiás / Tuberculosis in a Psychiatric Hospital in the state of Goiás, Brazil

OBJETIVO: Investigar a prevalência de infecção, doença e eventual surto institucional de tuberculose em um hospital psiquiátrico empregando teste tuberculínico, pesquisa de micobactéria em material da árvore respiratória e técnica de rastreamento molecular baseada na seqüência IS6110. MÉTODOS: Durante o período de fevereiro a agosto de 2002, foi realizado teste tuberculínico entre os 74 internos e os 31 funcionários de um hospital psiquiátrico na Cidade de Rio Verde (GO), pesquisa de Mycobacterium tuberculosis em material da árvore respiratória dos pacientes e estudo do perfil genético pelo método restriction fragment length polymorphism - IS6110. RESULTADOS: Micobactérias foram isoladas de 5 pacientes analisados (6,8 por cento), sendo em quatro M. tuberculosis e em um M. chelonae. Os isolados de M. tuberculosis foram sensíveis a isoniazida e rifampicina e, através da técnica restriction fragment length polymorphism - IS6110, apresentaram perfis genéticos únicos, totalmente distintos uns dos outros, indicando que os casos de tuberculose encontrados eram decorrentes de reativação endógena, não sendo possível caracterizá-los como um surto institucional. Através da realização do teste tuberculínico em dois passos nos pacientes, verificaram-se taxas de infecção de 23 por cento e 31 por cento. Entre os funcionários a taxa foi de 42 por cento, não tendo sido realizada entre estes a repetição do teste. CONCLUSÃO: Os resultados indicaram uma incidência considerável de tuberculose infecção entre os pacientes e funcionários, sendo também elevada a ocorrência de tuberculose doença entre os pacientes.

OBJECTIVE: To investigate the prevalence of infection, disease and eventual institutional outbreak of tuberculosis in a psychiatric hospital using the PPD test, as well as testing for mycobacteria in material collected from the respiratory tree and using molecular tracking technique based on insertion sequence 6110 (IS6110). METHODS: Between February and August of 2002, PPD tests were given to 74 inpatients and 31 staff members at a psychiatric hospital in the city of Rio Verde, located in the state of Goiás, Brazil. In addition, respiratory tree material collected from the inpatients was submitted to testing for Mycobacterium tuberculosis. RESULTS: Among the patients analyzed, mycobacteria were isolated from five (6.8 percent): four identified as M. tuberculosis and one as M. chelonae. The M. tuberculosis isolates were sensitive to isoniazid and rifampicin, and, when submitted to the restriction fragment length polymorphism/IS6110 technique, presented unique genetic profiles, totally distinct from one another, suggesting that all of the tuberculosis cases were due to endogenous reactivation. It was not possible to characterize this group of cases as an institutional outbreak. Performing the two-step tuberculin test in the patients, the infection rates were 23 percent and 31 percent, compared with 42 percent among staff members, who were submitted to the one-step test. CONCLUSION: The results indicate a high incidence of tuberculosis infection among inpatients and hospital staff, as well as a high occurrence of the disease among inpatients.

Importância do diagnóstico laboratorial na busca de casos de tuberculose em um hospital psiquiátrico / Searching tuberculosis cases in a psychiatric hospital: importance of laboratory diagnosis

Durante o período de fevereiro a agosto de 2002, a pesquisa de M. tuberculosis foi realizada entre 74 internos de um Hospital Psiquiátrico no interior do Estado de Goiás - Brasil. Micobactérias foram isoladas de cinco (6,8 %) dos pacientes analisados, sendo identificados quatro Mycobacterium tuberculosis e um Mycobacterium chelonae. A baciloscopia foi positiva apenas para a amostra de escarro contendo M. chelonae. O cultivo possibilitou o isolamento de M. tuberculosis a partir de espécimes clínicos de quatro pacientes com baciloscopia negativa. As micobactérias foram identificadas por meio de metodologia clássica, análise de ácidos micólicos e biologia molecular (PCR). A técnica de PCR, por tratar-se de um método mais sensível e específico, detectou M. tuberculosis em uma cultura em que apenas M. chelonae foi identificado por meio de técnicas convencionais. Os quatro isolados de M. tuberculosis foram sensíveis a isoniazida e rifampicina no método das proporções de sensibilidade as drogas, empregado neste trabalho